紅外顯微鏡即是用紅外線作為光源的顯微鏡，通過顯微鏡觀察被測樣品的外觀形態或物理微觀結構的基礎上直接測試樣品某特定微小部位的化學結構，得到該微區物質的高質量紅外譜圖，紅外顯微鏡結合了微區觀察和紅外測量功能。
紅外顯微鏡可見光設計的考慮涉及放大、分辨率和反差。*重要的可見光考慮的是分辨率，因為如果沒有高分辨率的能力，細微的資料在較高的放大倍數下是不可見的。顯微鏡紅外的考慮涉及光闌、樣品的聚焦和檢測器的靈敏度。
許多礦物在可見光中不透明，而在紅外線中則是透明的。利用紅外顯微鏡可以測定這些礦物的雙折射率、消光角、軸性及光軸角等光學常數。有的紅外線顯微鏡，是在偏光顯微鏡上安裝紅外光附件，既可進行紅外線照射下礦物的研究，又可進行普通的偏光觀察。另有立體紅外顯微鏡，對于研究化石較適用，也可用來研究礦物。
我們來看看紅外顯微鏡的常見行業應用有哪些?
1、聚合物有機材料研究中的應用
多層聚合物的測定 多層聚合物材料中，每層聚合物薄膜的厚度大多數是微米級的，紅外顯微鏡可以逐層對聚合物薄膜進行測試，特別是運用雙光闌系統和Tru-View磚利定位技術，固定出每層高聚物測試區域的準確部位，可方便地測出每層聚合物的紅外光譜圖。層壓復合材料的剖析 層壓復合材料是由多層不同材料粘合壓制而成。在建筑、產品包裝等獲得了廣泛的應用，顯微鏡可以容易地得到各層材料的紅外光譜圖。
2、在生化物質研究中的應用
對動、植物細胞組織的分子結構變化的研究非常有效。對**在細胞內分部情況的研究。
3、在微區分析中的應用
紅外顯微鏡主要特點是可以在毫克或微克級上對固體樣品進行紅外光譜分析，基本上是一種非破壞性的測試方式，在微區分析中可發揮重大作用。
4、微小顆粒的測定
微小斑點的測定，例如分析一塊媒炭樣品表面上或明或暗的不同微小斑點 2.3 微量污染物的測定 例如在精密的電子設備中一個微小的接觸點的鍍層上發現一顆約1~2ng的微粒，經紅外顯微鏡測定，可以確定物質。
5、在珠寶行業中檢測分析中的應用
測定寶石中包裹體內水、CO2等物質。無損測定寶石內或裂紋中的有機化合物。